История
Основой для создания сектора стали два структурных подразделения Института истории, философии и филологии СО АН СССР: созданный в 1967 г. Сектор истории дооктябрского периода (в 1968–1969 гг. его возглавляла д-р ист. наук М.М. Громыко, а затем до 1997 г. — чл.-кор. РАН, д-р ист. наук Л.М. Горюшкин) и образованный в 1970 г. Сектор историко-архитектурного музея под открытым небом, реорганизованный в июне 1993 г. в Сектор истории конца XVI — начала XIX вв. (до 1980 г. возглавлял д-р ист. наук О.Н. Вилков, в последующем — д-р ист. наук Д.Я. Резун).
В 1970–1990-е гг. сектор Л.М. Горюшкина активно занимался изучением опыта аграрного освоения Сибири во второй половине XIX — начале ХХ в., анализом социальной структуры сибирской деревни и составлением хроники крестьянского движения. В течение восьми лет сотрудники подразделения Л.М. Горюшкин, В.В. Кучер, Г.А. Ноздрин, А.Н. Сагайдачный, К.Б. Шустов обследовали фонды архивов и библиотек и собрали сведения более чем о 2,5 тыс. крестьянских выступлениях, из которых лишь 23% ранее были известны историкам. Результаты деятельности коллектива нашли отражение в ряде монографий Л.М. Горюшкина, трех томах хроники и получили высокую оценку специалистов. Еще одной заслугой Л.М. Горюшкина и его учеников Г.А. Бочановой и Л.Н. Цепляева стало возвращение из исторического небытия Новониколаевска-Новосибирска как городского поселения принципиально нового (индустриального) типа. В 1990-е гг. Г.А. Бочанова, Л.М. Горюшкин и Г.А. Ноздрин подготовили серию статей и две коллективные монографии, посвященные обобщению опыта благотворительности и народной агрономии в Сибири во второй половине XIX — начале ХХ вв.
Динамичное развитие исследований по истории Сибири периода капитализма во многом было связано с формированием научного направления под руководством Л.М. Горюшкина и подготовкой специалистов по этому направлению на отделении истории гуманитарного факультета НГУ. За 1967–1996 гг. под руководством Л.М. Горюшкина успешно защитили дипломные работы 93 выпускника, из которых впоследствии шестеро стали докторами исторических наук и 25 — кандидатами.
Сотрудники Сектора истории конца XVI — начала XIX вв. в 1970–1990-е гг. разрабатывали различные аспекты аграрного и промышленного освоения региона в XVII — первой половине XIX вв., историю сибирского феодального города. В последующем под руководством Д.Я. Резуна началась реализация проекта «Краткой энциклопедии по истории купечества и коммерции в Сибири» (1994–1999) в рамках комплексного изучения феномена дореволюционного предпринимательства и благотворительности, а также анализ опыта хозяйственного освоения Азиатской России, этносоциальных и этнокультурных процессов через призму концепции фронтира. В 1997 г. началось переиздание таможенных книг городов Сургут, Тара, Туринск, Кузнецк, Томск, Верхотурье, Красноярск, Тюмень, Тобольск, Кетск XVII в. с соответствующими комментариями и сопроводительными статьями. Т.С. Мамсик приступила к обработке массовых статистических материалов окладных книг волостей Среднего Приобья первой половины XIX в., первые результаты были опубликованы по Кайлинской волости.
Тяжелое финансовое положение Института истории СО РАН, болезнь и смерть Л.М. Горюшкина в 1999 г. привели к закрытию Сектора истории дооктябрьского периода. В июле 2001 г. сектор был восстановлен по инициативе директора института чл.-кор. РАН В.И. Ламина, пригласившего возглавить воссозданное научное подразделение д-ра ист. наук, заведующего кафедрой истории России НГУ М.В. Шиловского. В сектор пришли и другие ученики Л.М. Горюшкина: А.Н. Сагайдачный, Л.Б. Ус, А.К. Кириллов, а также бывшие сотрудники сектора — Г.А. Бочанова и Г.А. Ноздрин. Первые же годы деятельности ознаменовались рядом интересных исследований и выходом сборника по переселенческому движению: «Сибирские переселения. Документы и материалы. Новосибирск, 2003, вып. 1. В 2002–2003 гг. были проведены три масштабные конференции, и по их итогам опубликованы сборники материалов.
1 февраля 2007 г. Сектор истории дооктябрьского периода и Сектор истории конца XVI — начала XIX вв. были объединены в Сектор истории второй половины XVI — начала ХХ вв. под руководством М.В. Шиловского.